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大埔里的人文與自然數位博物館
(暨南國際大學)

台灣大型甲殼類資料庫
(海洋大學)

台灣大學地質科學數位典藏博物館-礦物篇
(臺灣大學)

台灣大學動物博物館
(臺灣大學)

台灣大學植物標本館數位典藏計畫
(臺灣大學)

台灣本土植物資料庫
(中央研究院植物所)

台灣貝類資料庫
(中央研究院動物所)

台灣昆蟲與璊類資源數位館
(行政院農業委員會農業試驗所)

台灣的魚類世界
(中央研究院動物所)

台灣科技文物與工業技術數位典藏-知識傳承的要角：印刷科技
(國立科學工藝博物館)

(中央研究院動物所)

台灣農田水利數位博物館

自然與人文數位博物館
(國立自然科學博物館)

貝類人文資料庫
(中央研究院動物所)

昆蟲標本典藏數位化計畫
(臺灣大學 )

東北角海岸風景特定區自然生態資源
(中央研究院動物所)

國立海洋生物博物館生物典藏與數位資訊網
(國立海洋生物博物館)

尋回台灣本土的淡水魚類
(中央研究院動物所)

植物大觀園
(中央研究院植物所標本館)

虛擬海洋生物世界
(國立海洋生物博物館)

臺灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫
(臺灣大學)

蝴蝶生態面面觀
(暨南大學、國立自然科學博物館)

蟲蟲總動員-昆蟲數位博物館
(臺灣大學)

蘭嶼專題
(中央研究院計算中心)

蘭嶼數位博物館—人之島
(國立自然科學博物館)